21世纪农业发展的主要方向是现代持续集约农业。基于我国庞大的人口、有限的人均资源、科技基础不足以及农业在国民经济中的特殊地位，合理开发农业资源、保护环境、防止污染和提高土壤质量至关重要。
目前，在我国农田施肥投入的总养分量中，约超过1/4的氮、1/3的P2O5、80%的K2O和90%的微量元素都依赖有机肥补给。采用有机肥是现代农业持续发展的重要基石。我国施用有机肥具有悠久的历史、广泛的地域及丰富的经验，并通过大量研究和实践验证了有机肥所具备的以下特性和功能：
(1)营养均衡，效果持久。有机肥不仅含有丰富的植物所需大量元素和微量元素，还富含胡敏酸、维生素、生长素等有机营养物质，堪称最全面的肥料。此外，有机肥施用量可以适当调整，在一定范围内不会影响作物生长。
(2)有机肥能够改善土壤理化特性，提升土壤肥力。含丰富有机质的有机肥通常约为200g/kg。作为重要物质基础，有机质对土壤肥力产生至关重要的作用。土壤有机质主要是腐殖质，占总量的50%-65%。作为一种复杂的有机胶体，腐殖质可以调节和缓解土壤酸碱度；提高阳离子交换能力以增强保肥功能；促进土壤有机质含量提升，利于良好土壤结构形成，尤其是水稳性团粒结构的增加，从而改变土壤的松紧程度、透气性、保持水分及热条件等方面，这些因素决定了良好的土壤肥力。因此，有机肥具备改善土壤理化特征、增强土壤肥力的优势。
(3)促进土壤微生物活动。土壤微生物在有机质转化过程中起着重要的作用，是衡量土壤肥力水平的重要标志之一。如土壤中有机质的矿质化过程，土壤中有机态氮磷的有效化过程，豆科植物生物固氮过程等，都与土壤微生物的作用有关。因此，施用有机肥料一方面增加了土壤有益微生物的数量和种群，另一方面为土壤微生物活动提供了良好的环境条件，使土壤微生物活动显著增强。
(4)有机肥有助于增强土壤微生物活动。土壤微生物在有机质转化过程中扮演关键角色，并被视为衡量土壤肥力水平的一个重要指标。例如，土壤中有机质矿化、有机态氮磷变成可利用形式以及豆科植物的生物固氮等过程都与土壤微生物密切相关。因此，施用有机肥既能提高土壤中益生微生物的数量和多样性，同时也为土壤微生物活动创造了优越的环境条件，从而显著提升土壤微生物的活跃度。
(5)降低肥料投入支出。有机肥便于就地获取、就地应用，资源丰富，价格低廉。提高适量有机肥的施用不仅能够改善地力、提升土壤养分含量，还可提高化肥的使用效率，从而减少化肥的用量，进一步降低农业成本。正是由于有机肥具备这些特性和作用，使得它在现代持续农业中发挥着不可替代的重要作用。
农业部近期在发布会上指出，发展有机肥既是形势所需，也是发展必然之路。过去为确保供给，化肥使用量确实较高。这不仅导致成本增加，还对生态环境产生了影响。现阶段进行化肥减量，包括实施有机肥替代化肥的政策，其目的并非完全放弃使用化肥，而是要降低过去不合理的用量和过高的使用趋势。当前推广农业绿色发展，有机肥取代化肥正是其中一项重要举措。
另外，在农业生产中出现了一个现象，既是过量化肥使用引发的土壤酸化和水体富营养化，同时又存在着畜禽粪污堆积未能有效利用导致污染。透过加大有机肥施用，便可解决这一难题。有机肥取代化肥的过程使得农牧业结合更加紧密，并让畜禽粪便得以合理利用。如此一来，不仅可以提高农产品质量，还具有多重益处，实际上是一项一箭双雕的好政策。
因此，推行有机肥既是实施科学发展观和构建社会主义新农村的重要战略措施，也是促进农业产量增加、农民收入提高的关键手段。它同样是提升农产品品质、增强市场竞争能力的紧密环节，更是发展循环经济、建设节约型社会的重大举动。同时，它还具备降低污染、培养地力、提高农业综合生产力的根本作用，以及降低生产成本、鼓励农民节约成本、增加收益的重要路径。
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