对于不同的堆肥原料，某些生产参数的变化情况并不完全一致。物料含水量、物料的配比参数（碳氮比）、温度、酸碱度、发酵时间等因素随物料的不同而异。在实际生产过程中，这些参数还有待于进一步确定，从而使产品更加稳定。
二、商品有机肥发酵工艺的确定
发酵工艺主要包括自然或生物发酵、好氧或厌氧发酵、不发酵。不同的堆肥原料应采用相应的发酵剂，以达到快速腐熟的目的。目前，普遍强调固氮、解磷、解钾等功能菌的作用，而忽视了生物发酵过程中存在的生理活性物质或酶的作用，忽视了有机物质的改土增效作用，进而出现了许多用实验室的优良菌种制成的肥料几乎无作用的现象，给消费者造成虚假宣传的不良影响。
① 好氧通气发酵。该发酵方式是生产商品有机肥的常用方式。该工艺存在的问题主要是发酵过程中有恶臭气体产生，在通风阶段尤为严重，一些厂家缺乏必要的处理装置而将其直接排放到大气中，危害到人体和大气；其次是增加了设备及污染控制的投资，增加了生产成本，还造成养分特别是碳、氮的损失较大。
② 发酵菌种质量。目前生产中使用的发酵菌种质量差异较大，许多实验室中培养的菌种，尽管其活菌数含量很高，但难以在发酵生产中取得良好效果；反之，复合菌种尽管菌数含量较低并有杂菌污染，但采用复合菌种的发酵效果较好。因此，应在生产前进行必要的菌种质量比较试验，以确保发酵效果良好。
③ 有机物料接种有机肥发酵剂的操作技术。实验室培养的菌种的特性因品种不同而异，适应环境的能力不同，对接种的技术要求也不同。而接种是有机肥生产中的重要环节，接种操作技术部规范，会影响有机肥的产量和质量。探讨行之有效的、专一的菌种接种技术，是有机肥生产厂家不可回避的问题。
三、商品有机肥腐熟度的确定
腐熟度的研究是一个复杂的工作。温度和PH的变化不能作为堆肥腐熟程度判别的全部指标。应充分利用化学分析法得到的参数，结合表观分析法对堆肥的腐熟程度作出判断。腐熟的堆肥中温度呈下降趋势，腐殖质的含量有所减少，堆料呈黑褐色，无恶臭味道，质地松软，无明显水分，蚊蝇等不再繁殖。
四、商品有机肥干燥工艺的确定
商品有机肥干燥法主要包括自然干燥、人工干燥、人工机械干燥和复合干燥。商品有机肥干燥工艺的弊端主要是粉尘污染。
① 械化人工高温快速干燥商品有机肥。在连续大规模生产商品有机肥时，必须使用烘干设备。尽管目前烘干温度仅为60-80℃，但烘干带来的空气污染、有效菌活力降低、养分损失等问题还较为突出。生物发酵干燥、保护设施日光干燥等技术利用生物能和日光能，可大幅度降低水分，再辅以机械耗能干燥，可较好地解决以上问题。亦可在不同季节采用不同组合方式进行干燥处理。
② 解决粉尘污染问题。生产中的粉尘污染给生产和环境带来了许多负面效应。目前采用的解决方法主要有：增加全封闭风送设施，采取重点污染区增加除尘器或采取先制粒再低温烘干的办法，以降低污染。
要想生产出优质商品有机肥，原料、技术、工艺以及严格的检测手段缺一不可，广大用户在选择有机肥生产厂家的过程中，一定要注意考察，如果生产厂家连基本的检测中心都没有，那产品的品质以效果肯定也没有保证可言。
