由于长期形成的直观认识，大家都认为农业废弃物、日常生活环境中的废弃物、餐饮业厨余、食品加工厂的垃圾、各种生物的排泄物都是臭的或存放后都会发臭。认为臭气(异味)是这些物质天生的特征。事实上这些废弃物绝大多数本来都不臭，而是染上各种微生物经繁殖后所产生的臭味物质。随着人们生活水平的提高，对环境的要求越来越高。人们通常对散发着臭味的物质避之不及，或用封闭方式予以隔离。管理部门对有机类废弃物处理单位以及生物
有机肥等有机类肥料生产企业提出强制要求，需要安装隔离封闭装置，并配备高耗能的物理淋吸装置如鼓风、喷淋等，再配上不断消耗吸附材料(如活性炭等)的化学除臭装置。这些除臭设备价格不菲，运营维持成本都很高。虽然建设时按管理规定购置了设备，但仅在督查时才开启运转的现象时有发生。物理和化学的方法都立足于将已产生的臭气除掉，而且隔离除臭装置和不停更换的都立足于将已产生吸附剂看得到摸得着，受到大多数人的青睐。物理和化学消除臭气的思仅仅停留在除臭，而没有思考臭气怎么产生的。可通过调整微生物代谢途径少产臭或不产臭。
代谢途径
微生物方法就是解决生物有机肥生产不产臭的一条行之有效的道路。关键是如何着手，如何用好此方法。在自然环境中到处弥漫着各种微生物，微生物比各种动植物先来到这个世界上，它们行使着物质转化的功能，由于它们的辛勤工作，维持了生态环境的良性循环。微生物担负着分解有机废弃物的功能，微生物在行使此功能时，有多种方式，最主要有两条道路，一条是不需要氧气的厌氧道路，另一条是需要氧气的好氧道路。厌氧道路上大多数中间产物都有不愉快的气味(臭味)，而好氧道路上的产物大多没有臭味。如果让微生物不走厌氧道路，只能走好氧道路就不产生臭味。所以调控微生物代谢途径是消除臭气的关键。
减少乃至不产生臭气的措施
1、控制养殖业排泄物臭气，首先从畜禽肚子抓起，可以在饲料中添加酵母、乳酸菌，排便臭气将大为减轻。
2、勤于清理畜禽粪便，决不设粪便收集存放池或堆积场长时间存贮以便销售粪便。打扫出的粪便最好在当日投人发酵装置(发酵槽、发酵池等)，并拌和发酵菌剂。
3、少采用泵打水冲洗的方式收集粪便，这种方法稀释了粪便，也增加了去除水分的成本。有的企业采用干湿分离机处理，结果含有营养成分的液体流失污染水域，而从干湿分离机获得的所谓干组分失去了相当多的营养，用干组分制作的肥料质量大大降低。收集水冲粪的液体粪便收集池则整天散发臭气。若过去建厂时不得已采用了水冲方式，只能将液体粪便输人沼气发酵池，让其密闭厌氧发酵产生沼气以及沼渣沼液。
4、生物有机肥生产进入发酵槽的畜禽粪便在添加菌剂后应及时翻抛，供氧充足的情况下不会产生臭味。
5、采用发酵床技术养殖的场所，应及时添加菌剂，增加翻拌发酵床次数;采用空松的不易分解的如稻糠、椰糠、锯屑等作发酵床垫料，臭气将大幅降低。
6、生物有机肥生产中采用非畜禽粪作为原料，如大棚藤蔓、食品加工废渣、食用菌采后基质(有的地方称废菇棒)、秸秆、餐厨垃圾等做原料的同样只要注重通风，增加翻抛次数，及时添加菌剂都不会产生影响环境质量的臭气。
7、采用农家土杂肥掭加豆浆红糖和推销菌种混合后再行堆制的方法应慎用，往往因通气不足产生臭气外，还因收集的土杂肥中带有的病菌一道繁殖，造成庄稼病害严重，实际中甚至因菌剂中带有条件致病菌，致使儿童和老弱者患病的事件，应引以为戒。
